香港警方收到一卷录影带，内容指出三名警队成员涉嫌当街对一名男子使用暴力。为此，香港警方投诉科的成员开始对机动部队（英文PTU）的成员进行调查。 　　机动部队的警员李永森（任达华饰）知道录影带中的警员乃是自己与同事，而被使用暴力的则是绰号“大麻成”的不法分子。于是阿森决定，对上隐瞒事件，对下寻找“大麻成”私了。而此时“大麻成”却不知去向。 　　机动部队的警员孖八（李国麟饰）因为财务问题向警队寻求援助被拒，而其在一次行动中又被上司撞倒使用暴力，孖八被逼上人生的绝路。 　　三队警察，在一夜之间紧张起来，他们能否解决各自的问题呢？

自从阿乐（任达华饰）当上和联胜办事人后，总算有一个过度性的安宁局面。然而，两年一度的办事人选举又一次即将来临。 　　现任办事人阿乐留恋身份权力，希望说服一众元老和邓伯（王天林饰）修例让其连任。而人马众多的Jimmy仔（古天乐饰）为被看好的新办事人人选，但他却只想着生意。一次交易，Jimmy在国内被捕，对方告诫他不可从事生意活动，除非身为办事人。为了大计，Jimmy终与阿乐反目，争当办事人。 　　另一边，阿乐为了铲除障碍，说服东莞仔（林家栋饰）与其联手，绑架Jimmy幕后老板以迫其放弃。一场腥风血雨的冲突拉开序幕，最后他们的恩怨如何解决？是否真能以和为贵？

二十年前因奸杀少女依芸入狱，重犯王远阳（张家辉 饰）在狱中历经凌辱，变成性格怪异、人见人惧的哑巴杀手。刚刚出狱的他，又卷入了一场惨绝人寰的命案之中：中英混血指挥家徐翰林被发现抛尸海边荒野，容貌尽毁遍体鳞伤，而徐翰林正是少女依芸的父亲。外号怒汉的警探林正忠（任达华 饰）一心查出真相，出狱后一直跟踪徐翰林幼女徐雪（文咏珊 饰）的王远阳，自然成为最大的嫌疑人，一场全港大追捕全面展开，然而，真相才刚刚开始被揭开……

从警十七年之久的王伟业（吴彦祖 饰），因为童年和家庭的原因，内心极度不安的他同时秉持着绝对的正义感，以致于其待人接物过程中矫枉过正，与同事交流多有不畅。在驻守急诊室的某个夜晚，伟业为某个急需稀有血型的重伤患者输血，谁知对方是作恶多端的银行抢劫团伙鬼王党的头目韩江（张家辉 饰）。伟业因此受到同事的谴责，而不久后韩江还偷偷溜走，旋即率领同伙犯下滔天大案，伟业的同事更在交火中火焚而亡。人在做，天在看，彪悍跋扈的韩江也从没想过自己会被欲望无情吞噬。另一方面，伟业的精神状况愈加令人堪忧，他拒绝接受心理辅导，宛如鬼魅一般执着地追踪韩江的同伙。　　他见证着背叛与杀戮，也坐视内心强大信念的轰然垮塌……

香港证券商人罗敏生（刘青云 饰）驱车上班途中遭遇车祸，这起看似平平常常的车祸却引来反恐队的关注。原来警方在罗的车内发现军用窃听器，反恐队长何智强（古天乐 饰）怀疑有人正在策划恐怖袭击。随着何的调查，始终藏在暗处监视窃听的退伍军人司马念祖（吴彦祖 饰）也渐渐浮出水面。与此同时，罗将被窃听的消息告诉了“地主会”的元老们，这是一群自70年代起便操纵香港金融的业界精英，如今更成为只手遮天的抢钱大亨。地主会遭人窃听，无疑预示着他们的各种黑幕将大白于天下。　　原以为只会是普通的勒索案，却将罗、何、司马等人卷入了万劫不复的漩涡之中……

香港国际警察杨丽清（杨丽清 饰）前往美国与当地的缉毒组组长东尼（甄子丹 饰）一起调查西雅图的一起贩毒案，当他们追查到当地的一名华人嫌疑人六仔（袁日初 饰），早已收到消息六仔潜回了香港，于是，杨丽清和东尼一起回到了香港。在追捕过程中，他们发现六仔不断受到追击，几次险些丧命。东尼开始觉得六仔绝对不仅仅是牵涉到这起贩毒案这么简单。当东尼和杨丽清一直追查下去时，发现整件事竟然关系到美国中央情报六局，而东尼的同僚另一组的组长迈克尔（王敏德 饰）竟然也牵涉在内。事件的真相真正一层层剥开。

华探长张铁柱（李修贤 饰）打拼十几年才有了探长地位，此人嫉恶如仇不事逢迎，与新任督察罗Sir多有摩擦，辛苦破案结果反被后者刁难。另一方面，悍匪“法官”（成奎安 饰）一伙购枪策划大行动，偷车贼伟仔（周星驰 饰）被法官收为外围助手，向其提供犯罪用车。法官与手下狂牛（黄光亮 饰）和鸡翼( 何家驹 饰)等人洗劫赌档，同一天伟仔因偷车嫌疑被张铁柱抓捕入监，赌档事发，罗Sir不顾张铁柱作证将伟仔定为嫌疑人，令张与伟仔二人大为不满。张铁柱将伟仔释放，同时要求伟仔合作抓捕法官一伙。购入武器的法官一伙战力大增，行事愈发嚣张，与其他帮派当街火并，伟仔被卷入杀人案件，只得配合张铁柱，一警一贼终于开始合作……

廉政公署收到报案人廖雨萍（周秀娜饰）的实名举报，举报正在坐牢的富二代曹元元（林峯饰）涉嫌行贿监狱里的监督沈济全（谭耀文饰）以及惩教员，首席调查主任陆志廉（古天乐饰）决定深入虎穴，卧底狱中。在监狱里，被陆志廉送入监狱的前警司黄文彬（林家栋饰）以及曹元元两大帮派势成水火，陆志廉趁机接近曹元元取得信任。同时监狱外的廉政公署总调查主任程德明（郑嘉颖饰）、国内反贪局行动处处长洪亮（丁海峰饰）也陆港联手，通力合作，最终成功破获贪腐行贿大案。

高级督察何尚生（刘青云）被劫持人质的劫匪伊健（郑伊健）点名到案发现场进行谈判，眼见伊健在现场的嚣张，何尚生斗意昂扬欲将其拿下，但被其逃脱。挫败激起何尚生的战意和好奇心，开始同伊健玩起“取赎金的游戏”来。　　何尚生收到伊健寄来的数件艺术品的残骸，在国际刑警Ruby（黄卓玲）的帮助下发现被破坏艺术品均在同一间国际级保险公司承保，猜想伊健意图勒索该保险公司，遂前往展开调查，而此时伊健恰好致电该公司高层Teresa（林熙蕾）勒索一千万，尚生即刻接手案件，却发现事情远非想象的那么简单。

倒卖人体器官集团的主脑洪文刚（古天乐 饰）罹患严重心脏病，为了活命他甚至计划摘取亲弟弟洪文标（恭硕良 饰）的心。为了完成卧底工作不惜身染毒瘾的志杰（吴京 饰）随老大去码头劫持试图逃跑的洪文标，他的上司见叔叔陈国华（任达华 饰）接到线报后也率队赶往现场，三方随即展开了激烈 的交火。侥幸逃生的志杰被送到泰国一所监狱，而掌控这里的狱头（张晋 饰）则与洪文刚有着千丝万缕的联系。女儿罹患血癌的狱警阿猜（托尼•贾 饰）对志杰的真实身份生出许多疑惑，而之后他无意中发现了监狱里的可怕秘密。　　为了营救侄子，陈国华不远万里追到泰国。而洪文刚仍在做着垂死挣扎，他最终陷入癫狂……

荷兰黑帮头目遭到暗杀，引发了一系列报复行动。其中，头目得力手下林健（梁朝伟 饰）回到香港展开了复仇行动。得到情报的香港警方派遣洛珊（麦翠娴 饰）和杜伊玲（梁艺龄 饰）保护了四名被健视为对头的人。健与珊、玲形成了对立关系。在一次围村行动中，珊和玲遇到了健的好友高辉（李子雄 饰）。原来，辉和珊、玲是青梅竹马，他们之间的感情在此次相遇中得以重新点燃。玲继续追踪健，但却在一次枪战中受伤。健毫不犹豫地冲上去救了她，这使得玲对健的态度逐渐改变，四人之间形成了复杂的亦敌亦友的关系。 　　为了对付健，对头人以围村村民的性命作为威胁。在面临生死存亡的关头，健、辉、珊和玲暂时放下了过去的恩怨，联手拯救人质。然而，在混乱中，辉被对头擒获，并受到严重的伤害。健见其痛苦，无法忍受，于是决定一枪了结了他的痛苦，然后与对头展开了最后的生死决战。

骆一峰是廉政公署的总调查主任，受署长命令成立一支特别小组，利用加密币造市案件去调查某银行高层贪污。于是骆一峰找到盖币的交易平台软件设计师—徐心帮忙，希望可以利用高科技进入平台搜证。众人一查下就发现银行的财政有出入，更把嫌疑人锁定为银行高层何进涛，过程中，被调查者遭神秘人袭击，而这时候银行主席亦遭绑架，然而，绑匪不但高调把绑架片段放上网引来公众关注，更要求以造市案有关的盖币作支付工具，因为种种巧合，更令骆一峰更相信造市案的幕后黑手与绑匪为同一个人，廉政公署誓要全力缉凶。

1991年，香港黑帮龙头倪坤被杀，倪氏家族旗下五大头目中除韩琛（曾志伟）外，均伺机背叛发难，不料却被倪家不起眼的第二代倪永孝（吴镇宇）不费一兵一卒牵制，此举引来重案祖督察黄志诚（黄秋生）的戒心，使其派出警校学生陈永仁（余文乐）渗入倪家进行长期的卧底工作，而韩琛为了巩固势力，早在警察内部安插了线人刘建明（陈冠希）。三年后，事业蒸蒸日上的倪永孝为安枕无忧，决意将五大头目一举歼灭，却因疏忽让韩琛成为漏网之鱼。　　1997年，大难不死的韩琛重出江湖，为替死去的同事报仇，黄志诚找到他商议合作除掉倪永孝的事宜，不久却发现此举铸成大错，而各自为自己的尴尬身份苦恼的陈永仁和刘建明，则在无间道的路上越行越远。

社团小弟阿华（黄宗泽饰）、阿飞（张继聪饰）、国仔（陈家乐饰）奉老大花锦（郑浩南饰）之命运送一笔社团资金，不料在运送途中遭遇埋伏，巨款不翼而飞…而花锦的死对头群哥（陶大宇饰）以此为由兴师问罪，企图抢走花锦即将得到的龙头之位。一时间权利之争愈演愈烈，三兄弟也被迫卷入这场纷争之中。金钱和道义面前三兄弟会如何抉择？花锦与群哥的双雄对决又将鹿死谁手？