本片描述了香港反黑组的组员惩治罪恶的英勇事迹以及他们个人感情经历的点点滴滴。人称“筋肉人”的反黑组探员阿喜（吴毅将 饰）立功无数、屡破奇案，但却因脾气倔犟，向来专横而和同事们诸多不顺。刚刚加入的康仔（陈浩民 饰）更是对阿喜诸多怨言，甚至想申请调组。后来一起办案多了，反黑组内部终于彼此了解，一团和气。反黑组内也有不少情事，一次上司阿凡（黎耀祥 饰）结识了卖鱼女阿娇，两人成了欢喜冤家；而阿弟（邵美琪 饰）更是一直暗恋阿喜，他们在工作上、感情上正经历着一次又一次的考验。

　　「超能干探」描写两位至交好友，陈一贤(郭晋安饰)及方志强(刘锡明饰)，两人至同道合一起考进了警察学校，后又分发到同一单位服务。
　　强生性善良没有心机，但处事有原则，不愿随波逐流，因此屡遭局内同僚排斥。而好友贤则恰相反，他聪明机伶，做人有手腕、心机深，起嫉妒心重，为了名利不择手段，因此很受同事长官器重。
　　一次，强在缉捕行动中受伤，子弹贯穿心肺之间，奇迹式的存活下来，但却从此产生了「超能力」。强连自己也不太能理解为什么能够「以眼代手」、「移形换影」或「电磁效应」。幸有一位奇人沈节(谷峰饰)，教强控制自己的超能力。
　　强与贤在一次缉捕歹徒的行动中，惊险万分，贤不慎受枪伤，而强则在危机中，不知不觉的使用了超能力逮捕获歹徒，强因而升职。
　　阮雯原为贤之女友，她一心一意守在贤身旁，但贤却因自私多次冷落阮雯，令阮雯若有所失。强自小暗恋雯，乃不时给予鼓励；雯不受贤重视，找强倾吐，两人爱苗渐滋生。
　　贤嫉妒强的升职，雯又向贤提出分手，并坦言爱上贤，贤因此更加愤恨。强被长官指派为诱饵，险象环生中又以超能力捕获歹徒，此时，高人石龙(王龙威饰)出现，以高强的功力将歹徒灭口。
　　贤亲眼目睹石龙的超能力，乃告知强，强一时大意，将子己拥有超能力之事坦言告之；贤乃求见沈节，沈节一眼看穿贤心术不正，劝他勿接近石龙，以免误入魔道。
　　但贤因公事不顺遂，巧遇石龙，石龙引诱他做徒弟，贤名利薰心，开始向石龙学习超能力。
　　马凤儿(彭家丽饰)因偶然的机会，认识了强的母亲关静红(苏杏璇饰)，两人颇为投缘，红不但将凤儿带回家，并要强照料凤儿。凤儿刁钻活泼，初时常捉弄强，但逐渐了解强的忠厚后，渐爱上强。贤因得知凤儿显赫的身世，利用强结识凤儿，贤渐对凤儿产生情愫，但凤儿却对贤没感觉，唯对强情有独钟。而雯虽屡遭凤儿言语及行动骚扰，却始终默默忍受。
　　贤与强被分为不同的二组，共同打击犯罪。但两组组长处事不合，导致两组人马处处抢功；在共同追查一桩重大刑案时，石龙因参与其中，龙要胁贤干出杀人勾当，自此，贤身陷魔道而不能自拔。
　　强之师父沈节原是大陆公安，来港为逮捕超能力高人石龙回大陆受审。强在不屈不挠的追查下，真相逐渐被解开，正当他掌握罪证据，却被石龙拦截，龙正要向强下毒手时，幸好沈节赶到，虽打走了龙但却身受重伤。凤儿也为了救强而牺牲了生命。
　　贤怕自己的事迹败露，不断以超能力杀人，并设计陷害强，强虽知贤种钟恶行，但顾念往惜情谊，不愿与贤决裂。
　　龙见贤事迹败露，认为贤已无利用价值，欲杀贤，幸得强与节搭救。贤不知悔改，反而悟得更深之魔法，将石龙除去，并做恶不断。
　　强忍无可忍，故意将雯遣至美国，并将红送回乡下，在无后顾之忧后，痛下决定和贤展开一场生死大对决.....。

　　无线当红冷面小生林保怡与被评为十大优雅人士之一的无线皇牌花旦陈慧珊再度携手合作，抽丝剥茧，侦破悬疑奇案。扑朔迷离的案情与循环反复的感情纠结在一起，令你无法抗拒！　　女法医聶宝言（陈慧珊）上集黯然与督察曾家原（林保怡）分手后离港，终因姐聶宝意（陈美琪）结婚而返港并复职。宝言、家言二人重遇，但因宝言看穿小棠（李珊珊）对家原仍未忘情，遂有所保留。　　小棠为成全二人，假意和宝言下属杨志伦（刘恺威）扮作情侣，宝言、家原终复合。另一方面，聶津津（钟丽淇）因觉曾家乔（鲁文杰）性格不合而提出分手，性格不合而提出分手，辗转与男模特儿袁天明（海俊杰）展开恋情，家乔无奈之余，迁怒袁天明妹妹袁天晴（陈采岚），二人终日斗法，成斗气冤家。　　宝言、家原合力侦破不少案件，感情更见一日千里。当二人得悉小棠和志伦只是伪装时，决定撮合她与有为律师王英杰（蔡子健），却不知令她堕入了死亡陷阱……

　　凌晨风（朱千雪 饰）是新界北冲锋队的警长，一次执行任务中，凌晨风的行动遭到了名为关鼎民（王浩信 饰）的男子的阻挠，最终爆发了一场恶战，凌晨风的父亲凌海（罗乐林 饰）不幸意外丧生，这让凌晨风十分自责，然而，让她没有想到的是，自己竟然拥有了能够使时光倒流的能力，她斗志昂扬回到了事发三日之前，希望能够挽救父亲的性命。
　　然而，事情却并没有凌晨风所想象的那么简单，回到过去的她，其一举一动都会牵连到未来的走向。最终，凌晨风顺利救下了父亲，却意外发现了一个警匪勾结的惊天阴谋。正义感满满的凌晨风毅然再度回到过去，却因此发现了冤家对头关鼎民不为人知的的善良一面。

　　这是一部警匪动作片。剧情的发展就像其他的警匪片一样，由不同的案子(单元)串起来。其实都差不多。
　　至於角色个性：
　　江华哥哥在剧中饰演一位非常机警、出色的警长生sir。阿生表面看起来好像是个吊儿啷当(就是痞痞的)的人，好像什麼都不在乎。但实际上他做什麼事都比人细心、认真负责，且处处为人著想。而阿诗(陈德容饰)，也由一开始对他的憎恶，慢慢地瞭解他、欣赏他，甚至到最後爱上他...
　　不过碰到了感情的问题，唉～这位生sir似乎就不像他办案那样的果决、干脆了！最初，认为自己配不上阿诗，即使心里喜欢，却仍装作不在意，甚至不承认、故意气走阿诗...

　　1<<铁窗速递>>
　　单元个案：惩教署发现监狱内有犯人不断收到违禁物品，高层怀疑有职员协助非法偷运。负责的调查员是陈锦鸿饰，亲自到惩教署深入调查，熟识内部运作方便找出犯人。他锁定其中一名犯人黄德斌，因他与女友袁彩云感情佳，入狱后又得到违禁品。最后揪出一名因欠下赌债的二级惩教助理阮兆祥，并当场在其身上搜获违禁品，并将涉案人等一网打尽。
　　真实个案：2001年，台北监狱受刑人勾结管理员在狱中贩毒被发现，一名吴姓受刑人涉嫌行贿狱政人员，利用手机，遥控外面的伙伴进行毒品交易。
　　2<<沙丘城堡>>
　　单元个案：指工程公司利用监管漏洞来偷工减料，令不合格工程的四十一层楼宇严重沉降，为保安全，房署决定拆掉该楼宇。
　　真实个案：轰动一时的1999年沙田居屋愉翠苑短桩案，其时桩柱公司利用监管漏洞偷工减料，令两座楼宇严重沉降，最终房署需拆卸楼宇，而违法者最终也被绳之于法，和2004的《短桩》差不多。
　　3<<亿万信用>>
　　单元个案：在廉政公署处理一宗诬告贪污案时，揭发另一宗指地产富商与银行高级职员非法勾结的亿万商诈骗案。
　　真实个案：香港500亿洗黑钱案。2001年，香港廉政公署宣布成功捣破了香港有史以来最庞大的跨境“洗黑钱”集团。廉署估计，这个集团至少已运作了5年，“洗黑钱”金额高达500亿港元。
　　4<<过界>>
　　单元个案：廉政公署收到3宗投诉，指高级警务人员收受利益包庇色情场所，展开调查后，揭发公职人员的失当行为，法庭以“以权谋私”的定罪因素作清晰阐释，此案便是将早年高级警司冼锦华一案变成内容，这集由陈国邦饰演高级警务人员，其他演员有惠英红及苗侨伟。
　　真实个案：有点类似改编自2003年香港高级警司冼锦华一案，涉嫌收受贿赂（包括免费性服务），以包庇色情场所，并在警方采取的“扫荡”行动前向黑帮组织通风报信。
　　5<<空卡>>
　　单元个案：九铁职员利用火车货卡，进行走私活动。由于货运系统即将全面计算机化，廉署只有一个月的时间进行调查，刻不容缓。为查出犯罪者，廉署调查员混入货运调度部工作，执行拘捕行动。
　　真实个案：其实早在2006年，违法分子曾在深圳与香港之间打通地道进行走私，在深港边界线的民宅设点，挖地道连接贯穿深港的下水道，走私电子产品。

　　乐琦（郭羡妮 饰）是香港警察保安科的督查，她美貌、身手、智慧并重，屡屡与恐怖分子打交道。今次，面对恐怖分子的炸弹勒索，她亲自部署了围剿行动，但在行动中汽车经纪坚强恰巧路过，使得行动受阻，最终虽然拘捕了恐怖分子头目和救回了坚强，但部分恐怖分子却成功逃脱了，保安科更是损兵折将。为了补充力量，同样身手不凡的美女警官丽花（佘诗曼 饰）和宝儿（杨思琦 饰）被调往了保安科，三人在随后的交往中建立了深厚的友谊。一日，坚强在将新车交付客户时又遇上了恐怖分子炸弹袭击，更因丽花想帮他解释越帮越忙而遭到车行解雇。正好女友此时又抛弃了他，银行又收回了他供的楼房，坚强的人生跌到了最低点，更视丽花为命中克星。乐琦觉得不能再让这些恐怖分子继续逍遥在外，于是决定冒一次险……

　　『真的力量 就在亚洲』，2005年，亚洲电视创作的重案实况剧集《危险人物》，收视与口碑同样创下骄人佳绩，成绩令人鼓舞。踏入2006年，亚洲电视再次掀起『奇案系列』的热潮，集合台前幕后的精英，倾全力製作《香港奇案实录》，演员阵容鼎盛，如陈啟泰、张文慈、张豪龙、江美仪、林韦辰、林燁、杨天经、袁文杰、吴亭欣、陈宝辕、杜挺豪、郭家颐、林伟、八两金、黄子雄、何彦樺、宝珮如等施尽浑身解数演出精彩。本剧将破天荒结合新闻片段，将多件轰动一时的重案，以实录式拍摄手法，重新展示在观眾眼前，并带出天网恢恢，罪犯最终难逃法网，得到应有惩罚的正确观念，相信定能再创收视佳绩。
　　《香港奇案实录》将重整惊人重案，包括：『雨夜狂屠』、『重装悍匪』、『老千计死人财』、『屋村狂父斩头』、『WTO危城六日』、『五尸离奇命案』等，箇中案情曲拆离奇，当中更涉及香港青少年及社会问题，希望观眾看后，可以更关注发生在我们身边的问题，引以为鑑，更关心社会及身边的人。