武当派的张翠山因为和邪教的堂主白眉鹰王的女儿殷素素相恋而为江湖名门正派所不齿，幸好武当派掌门张三丰深明大义，接纳了他们和儿子张无忌（马景涛 饰）。然而所谓的名门正派并不罢休，这天齐集武当派要求张翠山讲出他的结拜兄弟邪教的金毛狮王谢逊的下落，张翠山为人侠义，不肯出卖兄弟，为了不让师傅犯难，和殷素素一起自刎于六大派面前。张无忌就这样成了孤儿，由于无忌从小就身中奇毒，张三丰每隔一段时间都要为他输入真气为他续命，也正由于这样，无忌从小就不能练武，在武当派受尽年青一辈的欺负。一次偶然，无忌掉下了武当山崖，由此开始了他奇妙的江湖之旅。

　　康熙五十七年，皇族秋猎，于木兰围场遇暴客行刺，戌卫精兵溃伤，哈达亲王殒命，康熙怒遣皇四子雍亲王（郑少秋饰）南下缉凶。雍亲王爱新觉罗胤禛遂化名傅示真，微服简从南下查案，于石门结识江南名儒之女吕丝丝（梁琤饰），二人协力，铲桐山贼，保振远镖，几番出死入生，患难与共，情愫渐长，相知益深。
　　原木兰山左翼长刘勇，因行刺案遭牵连，身系囹圄，妻小流散。二子改从母姓，曰李卫，李才。卫辗转投至皇十四子大将军王麾下，于西疆屡建战功。才往石门奔东海书院，习文印诗，一心潜学。东海书院山长吕留良，即丝丝父，为士林巨擘，倡兴汉学，拒不仕清，又与反清组织江南八侠素有往来，深为朝廷所忌。
　　胤禛欲以康熙南巡发赈为饵，巧计拿敌。不意双方对峙少林之际，意外发现江南八侠之一虞慧儿，竟是十多年前落水失踪的十七格格，康熙望女得归，大喜，封为佛抱。
　　为保佛抱格格顺利入宫，胤禛托请丝丝傍随照料。丝丝遂辞别父亲，北上皇苑，与佛抱格格位，胤禛得总理大臣隆科多襄助，顺利登极，改元雍正。
　　为使胤禛断思，吕家将丝丝许给李才为妻。文定之礼方毕，吕父谢世，丝丝大恸。而雍正君临天下，治风勤严，与丝丝南北乖隔，遥相用忍。
　　李才得丝丝之鼓励，应考取官，一试中的，以状元内封大学士，侍命军机处，深为雍正所重。李卫亦为雍正收买，先后于皇十四子允示题胤祀与川陕总督年羹尧处卧底，雍正元年，胤祀囚景陵，三年，年羹尧遭赐死，李卫得扶摇直晋浙江巡抚。任内，查得石门东海书院有盗窃官粮，私通明遗之嫌，遂迭报军机处，请拿吕家。雍正十年，东海书院满门抄斩，两百馀命葬于乱坟。丝丝李才上京请命未及返回，得存。遭逢巨变，丝丝悲愤无已，誓谋雍正以报血仇。不料三刺未中，反遭雍正所制，二人限期共理朝政，十八个月后维民所止。丝丝遂擢封吕侍读，协助雍正改革赋役，整顿吏治。期限届至，雍正视死如归，丝丝不忍，延期活之。
　　李才丢官之后，游名山大川，写三朝演义，因书中触露宫禁，问罪被刑。丝丝感其情深义重，狱中委身，生子图报。
　　大限有期，天地会内外倾逼；雍正十三年八月廿三子夜，胤禛端坐就戮，丝丝苦剑徊肠，十五年恩仇难泯，牡丹亭生死成谜。
　　弘历即位，改朝乾隆； 二十年，闻说黄山之巅有双神仙侠侣，貌似雍正丝丝，众人登山寻访，却哪见仙踪侠影。正所谓，吴水深万丈，楚山邈千重，雌雄终不隔，神物会当逢。

　　明熹宗朱由校年少即位，酷爱木工、漆匠之艺，视朝政为畏途，使得太监魏忠贤得以逐步代理政务。
　　魏忠贤为了讨好皇帝，从三万童男中，挑出小木匠巴大家当熹宗皇帝的玩伴。皇帝玩伴理当是个太监，巴大家却阴错阳差的三番两次逃过净身手术。他和皇帝平起平坐惯了，有时忘了我，也跟皇帝称兄道弟起来，皇帝玩得尽兴便没事，要是心情不好，“兄弟”就成了出气筒。
　　巴大家的处世哲学是：混一天算一天，多占点小便宜，偶而吃点亏，一定得讨回，一旦对方来头大，那就君子报仇，三年不晚。
　　这样的巴大家，在东林党、阉党、与白莲教暗地教劲的过程中，因为他与皇帝的亲密关系，竟成了各方人马争相拉拢的对象。只不过，倒向这头，就会得罪那头，既是左右逢源，又是动辄得咎。他满心想的只是如何占便宜、混日子，却老被误以为是争权夺利。他越想走避上层的勾心斗角，却越身不由己的被卷入政争旋涡。
　　只有宫中的内书堂助教袁小玉和张倩，才稍稍了解巴大家。三个人之间发生了微妙的三角恋情，然而，随著时局演变，袁小玉成了白莲教乱党余孽，张倩成了乱党之後，让个巴大家的恋情莫名其妙的就轰轰烈烈起来。爱人既被打成“乱臣贼子”，他不想当烈士也不成了。
　　魏忠贤眼中容不下一粒沙子，他和皇帝的乳母客氏一直揽权，藉消灭异己来坐大自己。杀政敌，掌东厂，灭白莲教，迫害东林党，权势如日中天，他的党羽则行可改名，坐可认贼作父，倍极阿谀。魏忠贤越来越将巴大家视为眼中钉，必去之而後快。
　　巴大家成了通缉要犯，四处亡命，在泗洲目睹了白莲教的灭亡，在无锡见证了东林党人的受害，然而，绕了一圈回京师後，造化弄人，巴大家竟又成为皇帝的救命恩人，以及魏忠贤的政敌太监王体乾的拉拢对象。
　　熹宗皇帝驾崩後，新皇帝思宗小心翼翼的对魏忠贤展开反击。魏忠贤权力被架空，树倒猴孙散，客氏被一群存心报复的宫女箈死，魏忠贤则自缢於充军途中。
　　思宗有意重用巴大家，巴大家见新皇帝身边又围起了一群新的牛鬼蛇神，哪敢沾那腥膻？便与袁小玉相偕离京，迳自当个快活的木匠去了。