未来，地球环境变得愈来愈恶劣，人类纷纷踏上外太空移民的星际之路。一艘硕大的航天飞船遭遇空难毁灭，载着船长的逃生舱被另一艘飞船所营救。然而，逃生舱里只有被划定为非公民的夏娃·米勒中尉（玛丽娜·赛提斯 Marina Sirtis 饰），此时她呆呆傻傻，陷入混沌。船长命令部下提取她的记忆，从记忆中得知，已经怀孕的米勒中尉在灾难中和富兰克林船长、多默、汤姆森、李等共计五人登上了逃生舱。虽然米勒遭受其他人的歧视和羞辱，但她还是竭尽全力要寻找生还的希望。只不过最后舱里究竟发生了什么事？其他四人究竟去了哪里？ 米勒中尉的记忆中藏着可怕的未解之谜……
《红色派系：起源》的故事将沿用游戏的背景和人设：自Alec Mason带领火星殖民地重获自由已经过去了25年，而他的妻子被杀，女儿Lyra被绑架也过去了12年，Alec自那时起便已是一名破碎的英雄。他剩下的唯一的儿子，Jake Mason，现在已经成为了红派民兵(Red Faction Militia)的军官，当他发现12年前被绑架的妹妹至今还活着时，他的世界被颠覆了。 即使有新的敌人蜂拥至火星，但Jake依旧决定去寻找他的妹妹，但他发现Lyra现在却成了敌对势力的一员，一个冷血的战士，发誓要毁掉红派(Red Faction)。Kate Vernon将饰演The Matriarch，入侵者的族长。
隶属试剂盒科技公司的生物工程科学家赫伯特（David Staszko 饰）在深入伯利兹雨林考察期间遭遇神形硕大的杀人蜂，旋即人间蒸发，生死不明。三个月后，该科学家的相关资料传到他的女儿——美丽的昆虫学家吉娜·汉弗莱斯（Dominika Juillet 饰）手中。她从中大致确定了父亲失踪的地点，虽然那是一片禁止入内的区域，可是这个继承了父亲冒险精神的女子还是和助手朗达（Nikolette Noel 饰）闯入禁区。此时此刻，当地正处于战争动乱时期，她们成功说服驻扎当地的军官约翰（Corin Nemec 饰），随部队深入雨林。然而等待这群人的不只是敌人的枪林弹雨，更有巨蜂群的无情袭击，他们面临最凶险的处境……
